La Entidad inicia sus actividades en 1981, como Dirección Nacional de Transporte al asignársele una partida presupuestaria del Ministerio de Gobierno y Justicia.
Luego en la década de los 90 asume funciones que ejecutaba la Policía de Tránsito tal como la expedición de licencias, el cobro de infracciones menores, las actividades de los juzgados, la señalización vial.
Posteriormente mediante un acuerdo se trasladan las funciones de semaforización y señalización de las vías a esta entidad de transporte terrestre.
Con el transcurrir de los años se hace necesario establecer una política nacional en materia de transporte terrestre público de pasajeros para lograr una mayor eficiencia en la planificación, coordinación, operación y racionalización de las distintas modalidades por lo que el 28 de julio de 1999 se sanciona la Ley 34 que crea la Autoridad del Tránsito y Transporte Terrestre.